Actualmente su investigación se centra en la combinación de herramientas de bioinformática estructural con métodos modernos de síntesis orgánica y técnicas avanzadas de biología celular y molecular, para la identificación y desarrollo de nuevas moléculas bioactivas para el tratamiento de enfermedades neurodegenerativas, metabólicas e infecciosas. En los últimos 10 años, ha participado en como investigador principal y co-director de un Proyecto CORFO y coinvestigador de proyectos FONDECYT. Su investigación ha generado 57 publicaciones indexadas, varias solicitudes de patentes PCT y presentaciones en conferencias nacionales e internacionales. A nivel nacional, colabora con investigadores de la Universidad de Chile y Universidad Católica. A nivel internacional, colabora con el University College de Londres y el Institute Pasteur de Francia.

El Dr. Carlos F. Lagos obtuvo su título de Químico Farmacéutico en la Pontificia Universidad Católica de Chile el año 2008, y posteriormente el año 2016 se doctoró en Biotecnología en la Universidad Andrés Bello (Santiago, Chile). Antes de incorporarse a la Universidad San Sebastián, fue profesor asistente en el Departamento de Endocrinología de la Escuela de Medicina de la P. Universidad Católica de Chile. Actualmente es investigador principal del Laboratorio de Química Biológica y Descubrimiento de Fármacos y profesor de Farmacoquímica en la Escuela de Química y Farmacia, Facultad de Medicina y Ciencia.

Profesor Núcleo Académico Programa de Doctorado en Biología Computacional, Facultad de Ingeniería y Arquitectura, Universidad San Sebastián, Santiago, Chile, 2021-a la fecha. Profesor Colaborador Programa de Doctorado en Bioinformática y Biología de Sistemas, Facultad de Ciencias de la Vida, Universidad Andrés Bello, Santiago, Chile, 2020-a la fecha. Profesor Núcleo Académico, Programa de Magíster en Biomedicina Molecular, Facultad de Medicina y Ciencia, Universidad San Sebastián, Santiago, Chile, 2018-a la fecha. Profesor Colaborador Programa de Doctorado en Biología Celular y Biomedicina, Facultad de Medicina y Ciencia, Universidad San Sebastián, Santiago, Chile, 2018-a la fecha. Profesor Asociado, Cursos Profesionales Farmacoquímica I y II, Carrera de Química y Farmacia, Facultad de Medicina y Ciencia, Universidad San Sebastián, Santiago, Chile, 2013-a la fecha.