Modelamiento, simulación y diseño de proteínas, Simulaciones de dinámica molecular, biología es- tructural y biofísica de proteínas de membrana, cristalografía de rayos X, dispersión de ángulo pequeño (small angle scattering) de neutrones y rayos-X.

El Dr. Araya Secchi se ha dedicado a la investigación de las relaciones entre estructura dinámica y función de proteínas utilizando las herramientas de la biofísica computacional desde antes de comenzar su doctorado en 2009. Además ha tenido experiencia en el uso de técnicas experimentales de biología estructural como cristalografía de rayos-X, SAXS, SANS entre otras durante sus dos estadías postdoctorales en USA y Dinamarca. Durante su carrera como investigador ha contribuido a mejorar nuestra comprensión de la estructura y dinámica de diversas proteínas como conexina26, protocaderina15, y los receptores de hormona del crecimiento y prolactina entre otros. Actualmente se dedica a la investigación de la proteína piezoeléctrica prestin, esencial para el proceso de amplificación coclear en mamíferos y una proteína con una función única como motor de área. Para ello está utilizando las técnicas de modelamiento y simulación molecular y a través de colaboraciones explorando la resurrección de versiones ancestrales de prestina y la realización de experimentos de electrofisiología que permitan validar las predicciones computacionales. Además, se encuentra colaborando en proyectos de diseño de aptámeros de ácidos nucleicos para su uso como biosensores y en el diseño de nuevos péptidos amiloides con capacidades catalíticas.

Química General para estudiantes de primer año de plan común de Ingeniería. Clases de Biología Estructural y Biofísica en los programas de doctorado en Biología Celular y Biomedicina y Biología Computacional de la USS.