Las principales líneas de investigación del Laboratorio son la función de los canales iónicos y transportadores en las células del sistema inmune y del epitelio intestinal y de las vías respiratorias. Sus resultados describen cómo la activación o inhibición de ciertas proteínas de membrana puede usarse para reducir la gravedad de enfermedades como es el caso de la fibrosis quística, la enfermedad pulmonar obstructiva crónica y el asma. Ha publicado cerca de 30 artículos científicos sobre el tema y actualmente trabajan en el proyecto FONDECYT (1221257) titulado: “Lactato inducido alcalinización mejora el aclaramiento mucociliar en modelos animales de enfermedades muco-obstructivas” (2022-2026) y el Proyecto Internacional ( FOVI220118) para generar una red internacional de investigación en enfermedades muco-obstructivas de las vías respiratorias con la colaboración de investigadores nacionales e internacionales de la Universidad de Newcastle (Reino Unido) y la Universidad Federico II de Nápoles, Italia.

Luego de finalizar una Maestría en Fisiología en la UDeC, el Doctor Carlos Flores realizó sus estudios de Doctorado en la Universidad Austral de Chile, seguidos de un posdoctorado en el Centro de Estudios Científicos (CECs). Antes de incorporarse a la Universidad San Sebastián, el Dr. Flores instaló el Laboratorio de Transporte Transepitelial y Transdiferenciación en CECs donde ha participado como Investigador Principal en 3 proyectos FONDECYT y otro como co-investigador. Durante su carrera ha recibido una visita de investigación en el King's College de Londres y la Erica Lederhausens Minnesstiftelse para trabajar como profesor invitado en la Universidad de Gotemburgo en Suecia. Actualmente, es Profesor de Fisiología y Fisiopatología en la USS e Investigador Senior en CECs, donde también es Director Científico del Animalario y del Laboratorio de Transgénesis.

Carlos Flores es Tecnólogo Médico de la Universidad de la Frontera, Magíster en Fisiología de la UdeC y Doctor en Ciencias Biológicas de la Universidad Austral de Chile. Se desempeña como Investigador y enseña Fisiología y Fisiopatología en la Facultad de Medicina y Ciencias de la USS. Ha participado activamente en programas de Doctorado y Maestría de la Universidad Austral de Chile y Universidad de Chile impartiendo Fisiología Epitelial, y Fisiopatología de las vías respiratorias e intestinal.